299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lplt12 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 89 bp  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 84 bp  85.7  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 84 bp  85.7  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0036  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  86.49 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0032  tRNA-Leu  88.33 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145476  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60280  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1288  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0039  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14570  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0063  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0022  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0026  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0562961  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07707  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.650845  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309296  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  84.34 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0135  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.512997 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0108  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0016  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.718102  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0141  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0044  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0027  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.654797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0022  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.35191  normal  0.518198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0012  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0023  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0066  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0822521 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0040  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0062  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163456  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  82.72 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0025  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116004  normal  0.383928 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0082  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000269162  normal  0.128864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>