78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_R0051 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  87.78 
 
 
89 bp  79.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.79 
 
 
89 bp  79.8  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.79 
 
 
89 bp  79.8  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  95.83 
 
 
87 bp  79.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  87.78 
 
 
89 bp  79.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  87.78 
 
 
89 bp  79.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  87.78 
 
 
89 bp  79.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  90.79 
 
 
89 bp  79.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  90.79 
 
 
89 bp  79.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  90.79 
 
 
89 bp  79.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  90.79 
 
 
89 bp  79.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0037  tRNA-Leu  95.74 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000169907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0054  tRNA-Leu  95.74 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0764192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0029  tRNA-Leu  86.21 
 
 
87 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000562682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  95.65 
 
 
87 bp  75.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  86.52 
 
 
89 bp  75.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1224  tRNA-Leu  89.66 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0795794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  85.39 
 
 
89 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  85.39 
 
 
89 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  85.39 
 
 
89 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  85.39 
 
 
89 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  93.18 
 
 
89 bp  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  88.73 
 
 
89 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  83.91 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  91.49 
 
 
88 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  88.57 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  92.86 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  87.67 
 
 
86 bp  58  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  87.67 
 
 
86 bp  58  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  92.68 
 
 
89 bp  58  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  90.91 
 
 
88 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  96.88 
 
 
89 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0171  tRNA-Leu  86.67 
 
 
84 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.661922  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0027  tRNA-Leu  86.67 
 
 
84 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0610  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  54  0.000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0025  tRNA-Leu  90.48 
 
 
87 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90.48 
 
 
87 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2631  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0043  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.446566  hitchhiker  0.00000163601 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0008  tRNA-Leu  96.43 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  93.75 
 
 
90 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  90 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  93.75 
 
 
92 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  90 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  90 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  96.43 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.43 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  96.43 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  96.43 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0029  tRNA-Leu  96.43 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00602273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  90 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  96.43 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  96.43 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  93.55 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  96.3 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0036  tRNA-Leu  84.85 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0022  tRNA-Leu  84.85 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621595  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  96.3 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0015  tRNA-Leu  93.55 
 
 
93 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0025  tRNA-Leu  93.55 
 
 
93 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.680861  decreased coverage  0.000577389 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0011  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  88.1 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309296  tRNA-Leu  96.15 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  88.1 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19841  acetylornithine aminotransferase  96.15 
 
 
1257 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0786665 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  88.1 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  88.1 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.18 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>