87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_R0025 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0527771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00533985  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0044  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.784773  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1246  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.157019  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0029  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0060  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0072  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0068  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0026  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0057  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000872679  normal  0.444657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0742482  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000880716  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0040  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.208848  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1221  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.164315  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0067  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0006  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000413572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  87.27 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0013  tRNA-Leu  81.61 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0032  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209696  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00470609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0029  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0031  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.9705100000000005e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0606  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0008  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0013  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1722  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0010  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000185215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0049  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0051  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0015  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0020  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.020101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1100  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000893651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>