49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0040 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  94.03 
 
 		 85 bp  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  89.87 
 
 		 83 bp  87.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  92.42 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0070  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0067  tRNA-Leu  95 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988664 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0016  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.730547 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309291  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0037  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 81 bp  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0026  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.46023  hitchhiker  0.0000702886 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0048  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0046  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.592692  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0007  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0742482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0056  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0527771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000003449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00470609  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0026  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000394336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>