18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0067 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00988664 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0056  tRNA-Leu  89.41 
 
 
85 bp  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3379  hypothetical protein  96 
 
 
174 bp  83.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  90.62 
 
 
83 bp  79.8  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  97.44 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0070  tRNA-Leu  97.37 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142723  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  95 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  95 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  93.02 
 
 
88 bp  61.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0018  tRNA-Leu  88.68 
 
 
83 bp  58  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.125482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  93.02 
 
 
85 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507669  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0026  tRNA-Leu  96.15 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000394336 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0025  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316898  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.37116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>