44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_R0050 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0018  tRNA-Leu  90.36 
 
 		 83 bp  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.125482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  89.87 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  89.87 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0067  tRNA-Leu  90.62 
 
 		 83 bp  79.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988664 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0070  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0056  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000394336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0017  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000414228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0045  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0092775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0002  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.164011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0035  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1465  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03410  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.706698 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26300  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>