19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_R0018 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.125482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  90.36 
 
 		 83 bp  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0056  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0046  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.592692  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0048  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0007  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309291  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0067  tRNA-Leu  88.68 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0026  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.46023  hitchhiker  0.0000702886 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0052  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0070  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0160  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0258592  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366727  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0022  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.214962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>