91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0035 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0067  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0070  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0018  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.125482  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0016  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000272434  hitchhiker  0.0000231938 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0019  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.819942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0025  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20505  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0025  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316898  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26300  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03410  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.706698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24950  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0018  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742727  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0056  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0019  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212894 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000109128  hitchhiker  0.00302249 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.45142e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0079  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0022  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0049  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>