157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0058 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03410  tRNA-Leu  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.706698 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26300  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0050  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  95 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1465  tRNA-Leu  88.33 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  95 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0003  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0003  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0012  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.898265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0003  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0002  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0003  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257366  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00250  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5663  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.3138200000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0050  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000197413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0276  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0298  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000067681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5045  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5671  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000115086  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0069  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.649401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0003  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00430  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366056  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0003  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207592  hitchhiker  0.00400711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  93.75 
 
 		 98 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0027  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0003  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>