More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lppt43 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  100 
 
 		 98 bp  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0012  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.898265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 84 bp  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 87 bp  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna27  tRNA-Leu  92 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0036  tRNA-Leu  92.65 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230012  normal  0.790911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna19  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.320912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0035  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0610176  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0013  tRNA-Leu  90.28 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  83.8  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0107  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.57373  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0099  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.116508  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0140  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180283  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1796  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0107643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1814  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0017  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0064  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1968  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0042  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00515288  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0057  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1024  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00686094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0013  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0072  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2521  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000206835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0041  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  0.0670034 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0142  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162702  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0043  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0955991  normal  0.0560674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0044  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00489579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0058  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.031722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0122  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000181545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0123  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0019  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0047  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0045  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0044  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00713145  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1797  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0101943  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0023  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00937245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0075  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000964905  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0077  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0015  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0051  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000888669  normal  0.130057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0052  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000145228  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0053  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000187871  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0256  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0036  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.977915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0025  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0680936  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0082  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00186312  normal  0.0281447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0086  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0028  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0191582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0029  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00220383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0030  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00192839  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0045  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0150342  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0043  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00336489  normal  0.0463602 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0043  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0044  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0043  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.002346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0045  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481349  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0041  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0042  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00146649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0043  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00579317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60360  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5466  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0065  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62800  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0030  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000421149  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0010  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0031  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000068537  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0038  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000116483  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3551  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0019  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000288253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0018  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000477494  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0019  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000052132  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3649  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0020  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000559714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0037  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000758461  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3587  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.453688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3481  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3481  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4496  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00806213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0012  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313153 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3660  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0342114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5072  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000520026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>