115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2139 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  91.55 
 
 		 82 bp  93.7  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0020  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 82 bp  85.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0011  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 84 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00270882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  91.38 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0053  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.0218771 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  92 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  92 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  92 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 81 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 81 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 81 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 81 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 81 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 81 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0010  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0041  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.264208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0026  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 81 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000829114  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0039  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  87.93 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0033  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000656605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 82 bp  58  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 82 bp  58  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0029  tRNA-Leu  83.13 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.988938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0017  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777785  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  88 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  88 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  88 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  88 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  88 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  88 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  88 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 81 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 81 bp  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 81 bp  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 81 bp  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 81 bp  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt22  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0027  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0020  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24589  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0022  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4585  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0022  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>