28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PGt22 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PGt22  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0020  tRNA-Leu  92.73 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  91.38 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0039  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0043  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  87.93 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0021  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.308687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0164142 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0001  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0016  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.730547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0037  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0003  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0687845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>