8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_R0082 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.308687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0084  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_002950  PGt22  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3117t  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000600261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0068  tRNA-Leu  88 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0085  tRNA-Leu  88 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196786  normal  0.612491 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0086  tRNA-Leu  88 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.115514  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0164142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>