37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3117t on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3117t  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000600261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna084  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03630  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0023  tRNA-Leu  89.23 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2079  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000217449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0033  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0108  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0040  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3266  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0066  tRNA-Leu  84 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0822521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0026  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0364894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0062  tRNA-Leu  84 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163456  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0135  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.512997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0141  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232513 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0044  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0041  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0748  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0029  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000250179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0023  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0037  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0023  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0035  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.687906  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0042  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0267581  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0084  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0031  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0082  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.308687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0063  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>