94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2079 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2079  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000217449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0108  tRNA-Leu  97.47 
 
 		 85 bp  141  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna084  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03630  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 82 bp  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0141  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0135  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.512997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0062  tRNA-Leu  92.54 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163456  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0066  tRNA-Leu  92.54 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0822521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0364894  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0044  tRNA-Leu  94 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0023  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0040  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0033  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44508 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3117t  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000600261  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0032  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145476  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0023  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618598  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0029  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0035  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000157921  normal  0.648742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0074  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.300067  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0016  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0030  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0042  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0041  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102263 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0037  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0029  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000250179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0031  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0035  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.687906  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0412  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.56087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1805  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0032  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1129  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.157736  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1064  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0018  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000323651  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0068  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478917  normal  0.0818589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0084  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0020  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012052 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0022  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0068  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000344448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0080  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0062  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0010  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000141712  hitchhiker  0.00444268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0030  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0023  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0034  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0040  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0035  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0731523  normal  0.959271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1060  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148501  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0016  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1298  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199566  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0076  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606872  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0046  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2360  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1434  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0008  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0100798  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0006  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831303  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lplt42  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt42  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.247975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03461  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0132208  normal  0.375056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.806101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0076  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.445287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1149  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416978  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1289  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0738  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0135197  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0839  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0024  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000365355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0066  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000299649  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0079  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0068  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000144281  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0076  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.243521  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0041  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000982654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0013  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14570  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0043  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.446566  hitchhiker  0.00000163601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1288  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2631  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60280  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0634  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.323401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0243  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>