24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03630 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_rna084  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  163  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03630  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2079  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000217449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0135  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.512997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0141  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0066  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0822521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0062  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163456  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0108  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3117t  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000600261  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0044  tRNA-Leu  96 
 
 		 87 bp  83.8  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0029  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0033  tRNA-Leu  89.23 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0026  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0364894  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0035  tRNA-Leu  92 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000157921  normal  0.648742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0023  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0032  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145476  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0023  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618598  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0074  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.300067  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0040  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0016  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0022  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>