23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_R0084 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_R0084  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0082  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.308687 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0016  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.460002  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0029  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0035  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000157921  normal  0.648742 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3117t  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000600261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0044  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05676  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna005  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.240407  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna003  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00119641  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna121  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000362621  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3174t  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000836085  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3171t  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0569623  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000548287  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05682  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02743  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00669255  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0063  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000700338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0074  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.300067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3266  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>