34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_R0021 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0049  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.273052  hitchhiker  0.00863967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt22  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0031  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0756362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  87.27 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.988938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0029  tRNA-Leu  82.5 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0406184  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0036  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>