45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0016 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.730547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0037  tRNA-Leu  96.34 
 
 		 81 bp  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0001  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 81 bp  123  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0003  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 81 bp  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0687845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0007  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0046  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.592692  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0048  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309291  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0026  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 82 bp  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.46023  hitchhiker  0.0000702886 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  89.16 
 
 		 1389 bp  93.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309185  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0718906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309118  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.253847  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309067  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.086825  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309361  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309143  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0002  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0029  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0030  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 81 bp  83.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0034  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 81 bp  83.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0030  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0016  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000272434  hitchhiker  0.0000231938 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  92.5 
 
 		 1356 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  84.34 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0004  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00803834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0052  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0022  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.17393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0038  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt22  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>