29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_R0029 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309185  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0718906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309361  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309143  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  92.68 
 
 		 1389 bp  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309067  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.086825  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0002  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 82 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309118  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 82 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.253847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0016  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.730547 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0007  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309291  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0046  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.592692  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0037  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 81 bp  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  100 
 
 		 1356 bp  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0001  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 81 bp  75.8  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0003  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 81 bp  75.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0687845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0048  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0026  tRNA-Leu  82.93 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.46023  hitchhiker  0.0000702886 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0107  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.57373  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0004  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00803834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0101  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000279606  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>