22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_R0101 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_R0101  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000279606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0034  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0742482  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0100  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568264  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  83.82 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  90 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0047  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.665018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0029  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309185  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0718906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>