117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_R0067 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0018  tRNA-Leu  95 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0115557  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0017  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000414228  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  54  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 82 bp  54  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  54  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  54  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0011  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00270882  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0025  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0595639  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0027  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0065  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0063  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200123  decreased coverage  0.00662363 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26300  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03410  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.706698 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0050  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5663  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t19  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t20  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.3138200000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4338  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0004  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0009  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0052  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0014  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0034  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.566958 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0108  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000140726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0003  tRNA-Leu  83.58 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0036  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247967  decreased coverage  0.00943738 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0645  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.282647  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309087  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309138  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0022  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0013  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309179  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0009  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553252  normal  0.0230597 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1044  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255738  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0000161496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0039  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477957  normal  0.0356548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0043  tRNA-Leu  83.58 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000564776  hitchhiker  0.00000000298253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6043  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.843688 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0101  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000279606  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0047  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.899585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0030  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299812  normal  0.066505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0298  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000067681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5671  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000115086  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5045  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0276  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4568  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.666254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0030  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>