295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_tRNALeuVIMSS1309138 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309179  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309087  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309138  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309360  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0042  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553252  normal  0.0230597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0000161496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4568  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.666254  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1044  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255738  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419334  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t19  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t20  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4338  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6043  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.843688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299812  normal  0.066505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477957  normal  0.0356548 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.566958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247967  decreased coverage  0.00943738 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0645  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.282647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.899585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 81 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 81 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0031  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0007  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309184  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309276  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0022  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0058  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0025  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0079  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.966299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0078  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.914588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0026  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0048  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.547841 
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03726  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0825956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0037  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17135  normal  0.776036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0072  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0073  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0032    100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.333089  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0077  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.941886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0002  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0074  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0037  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1768  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0024  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0024  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.279454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0017  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888943  normal  0.34403 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0059  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418703 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0064  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1764  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000024558  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0002  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.164011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0035  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA39  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.220768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1772  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0076  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737133  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0037  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583149  normal  0.146154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0038  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360445  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309143  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0033  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0594182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0034  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0585247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0013  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  96.43 
 
 		 1389 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309067  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.086825  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309118  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.253847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0021  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>