More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_R0020 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  98.82 
 
 		 85 bp  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 83 bp  81.8  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  89.33 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  89.33 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  95.83 
 
 		 87 bp  79.8  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0030  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0029  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0406184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0072  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  90 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0086  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00069  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000211563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00086  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0554728  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4874  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000096251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0081  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5113  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164855  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4969  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000625029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4161  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000230562  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4911  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000387587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4213  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0094  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0443375  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0122  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000057209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4712  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.855369999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4961  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000179002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4915  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000252066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4163  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000225021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4159  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000704733  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4321  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000341532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4956  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.62786e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4963  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000169309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0989322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4909  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000511296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4729  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000255517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4808  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000052486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4144  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000390676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4806  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000584186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4917  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000963852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5115  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4958  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4876  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000008654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4262  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000100431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4967  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000670615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5232  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000856484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5234  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0018  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0174601  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5882  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.119438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>