127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0008 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  87.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  87.21 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1519  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428065  normal  0.832242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5663  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.3138200000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  84.34 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  84.34 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0050  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000197413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0298  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000067681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5671  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000115086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5045  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0276  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0056  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.756385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0017  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000414228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0033  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000656605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0012  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.898265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0026  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000829114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0039  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0545231  normal  0.269092 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  83.72 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0064  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>