More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_R0053 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0012  tRNA-Leu  96.39 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.898265 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  95.35 
 
 		 98 bp  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna19  tRNA-Leu  89.16 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.320912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0035  tRNA-Leu  89.16 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0610176  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  92.19 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0013  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna27  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0036  tRNA-Leu  89.19 
 
 		 87 bp  83.8  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230012  normal  0.790911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0058  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.031722  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1814  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1968  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0064  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1024  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00686094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1797  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0101943  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0017  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2521  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000206835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0041  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  0.0670034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0043  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0955991  normal  0.0560674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0042  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00515288  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0142  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162702  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0044  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00489579  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1796  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0107643  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0099  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.116508  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0107  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.57373  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0122  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000181545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0123  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0256  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0140  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180283  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0043  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00336489  normal  0.0463602 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1748  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0043  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00579317  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0042  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00146649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0041  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498551  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0019  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000052132  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0018  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0031  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000068537  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t101  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000108227  normal  0.0525224 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0019  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000288253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0023  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00937245  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0044  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00713145  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0077  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0043  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t102  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000565255  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1969  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0144  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00805168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1815  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1022  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0362135  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0018  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000477494  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0072  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2520  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455871  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0037  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000758461  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0033  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000096858  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0030  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000421149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0038  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000116483  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0025  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0680936  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0045  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0150342  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0044  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0028  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0191582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0029  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00220383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0030  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00192839  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0057  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0043  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.002346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0045  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0020  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000559714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0045  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R11  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna115  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000448705  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0013  tRNA-Leu  92 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3125t  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.556265  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna008  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000945853  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06707  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03400  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  88.52 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0298  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000067681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.3138200000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5045  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>