268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_R0079 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  99.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  92.54 
 
 		 82 bp  93.7  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  92.42 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  91.8 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  90.62 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0038  tRNA-Leu  90.16 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.03097 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  89.23 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu03  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0175696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0011  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00270882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0017  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.137168  normal  0.352813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0033  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000656605  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0026  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000829114  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0029  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.988938  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  60  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>