210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Leu-6 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  167  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  97.62 
 
 
84 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  97.62 
 
 
84 bp  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  97.62 
 
 
84 bp  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  97.62 
 
 
84 bp  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  97.62 
 
 
86 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  97.62 
 
 
86 bp  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  97.62 
 
 
86 bp  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  97.62 
 
 
86 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  97.62 
 
 
86 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  97.62 
 
 
86 bp  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  97.62 
 
 
86 bp  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  97.53 
 
 
81 bp  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  97.53 
 
 
81 bp  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  97.53 
 
 
81 bp  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  97.53 
 
 
81 bp  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  97.53 
 
 
81 bp  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  95.18 
 
 
83 bp  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  93.9 
 
 
84 bp  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  95.12 
 
 
82 bp  123  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  95.12 
 
 
82 bp  123  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  93.98 
 
 
85 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  93.67 
 
 
84 bp  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  93.67 
 
 
84 bp  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  93.9 
 
 
82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  92.68 
 
 
82 bp  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.46 
 
 
82 bp  99.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.46 
 
 
82 bp  99.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  91.46 
 
 
82 bp  99.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  91.46 
 
 
82 bp  99.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  91.46 
 
 
82 bp  99.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  89.16 
 
 
85 bp  85.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0026  tRNA-Leu  97.87 
 
 
81 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000829114  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  89.16 
 
 
85 bp  85.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  97.83 
 
 
85 bp  83.8  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  79.8  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000656605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0057  tRNA-Leu  95.65 
 
 
80 bp  75.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0744744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  97.62 
 
 
82 bp  75.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  89.23 
 
 
86 bp  73.8  0.000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  95.45 
 
 
82 bp  71.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  95.45 
 
 
85 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  88.16 
 
 
85 bp  71.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  86.67 
 
 
84 bp  69.9  0.00000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0017  tRNA-Leu  86.75 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.137168  normal  0.352813 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  89.66 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  87.88 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  86.59 
 
 
82 bp  67.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  86.59 
 
 
82 bp  67.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0004  tRNA-Leu  87.88 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00103905  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0039  tRNA-Leu  88.41 
 
 
82 bp  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00813097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  90.77 
 
 
84 bp  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  97.3 
 
 
86 bp  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  91.84 
 
 
87 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  84.71 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0037  tRNA-Leu  93.02 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21797  normal  0.0832006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0039  tRNA-Leu  93.02 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368891  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  91.49 
 
 
82 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0038  tRNA-Leu  93.02 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00398477  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0039  tRNA-Leu  93.02 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00836126  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  92.86 
 
 
80 bp  60  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  92.86 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  92.86 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  92.86 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  92.86 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  92.86 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  92.86 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  92.86 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  92.86 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  92.86 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>