236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0024 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  96.92 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0033  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000656605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0043  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 83 bp  83.8  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.45142e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  79.8  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  79.8  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  79.8  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0057  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 80 bp  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0744744  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0032  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 83 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000109128  hitchhiker  0.00302249 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0026  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000829114  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t13  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0039  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0039  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0039  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813097 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0552  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0183595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 80 bp  60  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0004  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  60  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00103905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0086  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000003449  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0024  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0041  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000041426  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0045  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0037  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17135  normal  0.776036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0024  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>