230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_R0034 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  98.82 
 
 		 85 bp  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  97.65 
 
 		 85 bp  153  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0033  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000656605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  90.62 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1765  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  94 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00013  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000122077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0062  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.8923600000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0762  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000162709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0796  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000227497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0723  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0063  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5018  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000585411  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4653  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.43114e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0784  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000606436  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0030  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.249207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0075  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000116589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0459  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000131572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0691  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0034  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000358312  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0034  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000338486  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  89.23 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0831  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000791902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0737  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000058826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0062  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0026  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 81 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000829114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0037  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21797  normal  0.0832006 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0039  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368891  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0032  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000109128  hitchhiker  0.00302249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  91.84 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>