200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0038 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.03097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  95.06 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 82 bp  95.6  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0122  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0035  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000172953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0093  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000286418  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0095  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0099  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588757  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0158  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0148  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0150  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0152  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0155  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  90.16 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0022  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t015  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4585  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0022  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0111  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000389505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0128  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0020  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24589  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0119  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t010  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000827659  hitchhiker  0.00000000052642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0124  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141518  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0127  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000102689  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0011  tRNA-Leu  92.16 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00270882  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0027  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000000908106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0120  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00172985  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0105  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651737  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0128  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00106969  normal  0.52847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0130  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584266  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0133  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000286761  normal  0.279281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0030  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.551474  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  88.52 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t019  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0031  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0033  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505134  normal  0.14321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0037  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519454  normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0034  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  normal  0.115675 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0038  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000710628  normal  0.113479 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0039  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000435375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0032  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000103773  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0036  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000195889  normal  0.0261952 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0107  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109808  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0100  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000931181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0104  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000390142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0115  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t014  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000624241  hitchhiker  0.000000000488126 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0124  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00204049  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  86.89 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0360515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000434442 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0020  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.873101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0029  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.988938  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0017  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.347732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0055  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.796576  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0037  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0014  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.582798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0014  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0055  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97975  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0025  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.426902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0029  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0013  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0020  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639768  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt50  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.916446 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  85 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0012  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0022  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210524  normal  0.0833879 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  84.38 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  84.38 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  82.28 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>