73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0011 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00270882  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 87 bp  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  92.73 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0038  tRNA-Leu  92.16 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.03097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  90.2 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0029  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0406184  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  87.27 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0053  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.0218771 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0029  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.988938  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  89.8 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0126  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000786823  normal  0.701139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t093  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t102  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000565255  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0126  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553004  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0020  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000421149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0123  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000758461  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000052132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000477494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0128  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00106969  normal  0.52847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0130  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584266  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0133  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000286761  normal  0.279281 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0120  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00172985  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0124  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141518  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0127  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000102689  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>