More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_R0045 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0033  tRNA-Leu  92.77 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  90.36 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  90.36 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  90.36 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0035  tRNA-Leu  89.16 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0610176  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna19  tRNA-Leu  89.16 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.320912  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  88.37 
 
 		 98 bp  91.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 84 bp  87.7  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0013  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna27  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0027  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  87.65 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0036  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230012  normal  0.790911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0038  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0033  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0012  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.898265 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0003  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.426461  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00069  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000211563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00085  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00086  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0554728  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0080  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.02179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0081  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4963  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000169309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0029  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.322054 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0094  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0443375  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0095  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0436868  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0022  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5234  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4909  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000511296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0023  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0030  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0021  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0067  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0076  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0068  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5882  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.119438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4874  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000096251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4213  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4712  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.855369999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4728  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4915  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000252066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4876  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000008654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4916  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000645766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5114  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153961  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0028  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4917  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000963852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0075  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4806  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000584186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0069  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4807  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000360062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4808  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000052486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4875  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000898834  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4144  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000390676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4161  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000230562  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4956  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.62786e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4957  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4958  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4910  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00037453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0122  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000057209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4961  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000179002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4163  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000225021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4321  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000341532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4968  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000650666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4967  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000670615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4969  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000625029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4729  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000255517  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5232  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000856484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4962  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000175711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5115  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4262  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000100431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5113  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0005  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000329783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4159  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000704733  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0016  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00811405  normal  0.0178437 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0074  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0010  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000415832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>