87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0027 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  89.77 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.0000012405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0022  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5663  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.3138200000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0276  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5045  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5671  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000115086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0050  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000197413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0298  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000067681  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0006  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000531495  normal  0.328026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  90 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0039  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0051  tRNA-Leu  90 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  90 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  83.1 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0057  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000872679  normal  0.444657 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.102208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  82.72 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1764  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000024558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1768  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1772  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>