More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_R0021 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  97.7 
 
 		 87 bp  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0012  tRNA-Leu  93.98 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.898265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  111  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  111  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  90.7 
 
 		 98 bp  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0035  tRNA-Leu  89.16 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0610176  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna19  tRNA-Leu  89.16 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.320912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna27  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0036  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230012  normal  0.790911 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0042  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00515288  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0058  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.031722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0017  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1968  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0033  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1796  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0107643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1024  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00686094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2521  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000206835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0041  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  0.0670034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0044  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00489579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0043  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0955991  normal  0.0560674 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1814  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0142  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  87.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0065  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4554  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200123  decreased coverage  0.00662363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0001  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0017  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0078  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.914588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03726  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0825956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0048  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.547841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0079  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.966299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0021  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  86.25 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0003  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0077  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.941886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0076  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737133  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0059  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0064  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0043  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0043  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00336489  normal  0.0463602 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0000968833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0044  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0031  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000068537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0030  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000421149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0038  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000116483  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0023  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00937245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0077  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t101  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000108227  normal  0.0525224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0018  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000477494  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0020  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000559714  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0019  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000052132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0025  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0680936  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0013  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0045  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0150342  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0044  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00713145  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0028  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0191582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0029  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00220383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0030  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00192839  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0057  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0045  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0043  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.002346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0045  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481349  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0041  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0042  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00146649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0043  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00579317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t102  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000565255  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0019  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000288253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0037  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000758461  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt10  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0026  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344693  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0038  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0991  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0080  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.02179  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0109  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000331868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>