299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_R0052 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0015  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 90 bp  95.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0014  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  0.6782 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.193422  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0025  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_006368  lppt22  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt22  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60600  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0013  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0072  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60590  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0029  tRNA-Leu  85.33 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65210  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65220  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5665  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5666  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2501  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0021  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0535721 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0059  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0051  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361468  hitchhiker  0.00416301 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0099  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0035  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.331877  hitchhiker  0.00233917 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0051  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075209  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0051  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0049  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0022  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03938  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0015  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20772  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0017  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.347732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0012  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0022  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210524  normal  0.0833879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0038  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24950  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0022  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0025  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132297  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0043  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.025828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0014  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.582798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0014  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0055  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97975  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0021  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144859  normal  0.471234 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0029  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0041  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0012  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.898265 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0025  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.426902  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  87.27 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0016  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.672114  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0009  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0903  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0060  tRNA-Leu  84 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  89.09 
 
 		 83 bp  54  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0026  tRNA-Leu  84 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0057  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311538  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0068  tRNA-Leu  84 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>