195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_R0035 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.331877  hitchhiker  0.00233917 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361468  hitchhiker  0.00416301 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0099  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075209  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0059  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  98.85 
 
 
87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2501  tRNA-Leu  98.85 
 
 
87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  98.85 
 
 
87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  98.85 
 
 
87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  98.85 
 
 
87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  98.85 
 
 
87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  98.85 
 
 
87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  98.85 
 
 
87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0021  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0535721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  95.06 
 
 
87 bp  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0043  tRNA-Leu  92.59 
 
 
87 bp  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.025828 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0038  tRNA-Leu  95.52 
 
 
87 bp  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667978  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0041  tRNA-Leu  95.45 
 
 
87 bp  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27716  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0022  tRNA-Leu  91.36 
 
 
87 bp  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0017  tRNA-Leu  94.03 
 
 
87 bp  101  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.347732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0014  tRNA-Leu  94.03 
 
 
87 bp  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.582798  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0014  tRNA-Leu  94.03 
 
 
87 bp  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306064  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  94.03 
 
 
87 bp  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0055  tRNA-Leu  94.03 
 
 
87 bp  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97975  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_003295  RS03938  tRNA-Leu  92.54 
 
 
87 bp  93.7  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0015  tRNA-Leu  92.54 
 
 
87 bp  93.7  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20772  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0022  tRNA-Leu  92.54 
 
 
87 bp  93.7  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142983  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0021  tRNA-Leu  92.54 
 
 
87 bp  93.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144859  normal  0.471234 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0025  tRNA-Leu  92.54 
 
 
87 bp  93.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132297  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0029  tRNA-Leu  92.42 
 
 
87 bp  91.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0025  tRNA-Leu  92.42 
 
 
87 bp  91.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.426902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0022  tRNA-Leu  91.04 
 
 
87 bp  85.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210524  normal  0.0833879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0012  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  87.65 
 
 
87 bp  81.8  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  90 
 
 
86 bp  71.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00013  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000122077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0062  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.8923600000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0062  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0075  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000116589  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0030  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.249207  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0796  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000227497  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4653  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.43114e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0459  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000131572  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0831  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000791902  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0737  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000058826  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0784  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000606436  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0723  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0762  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000162709  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0691  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152915  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0034  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000338486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0063  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0034  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000358312  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5018  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000585411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0033  tRNA-Leu  86.57 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  93.02 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1765  tRNA-Leu  93.02 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1770  tRNA-Leu  93.02 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1774  tRNA-Leu  93.02 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900033  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1776  tRNA-Leu  93.02 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000114198  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt10  tRNA-Leu  86.36 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202771  hitchhiker  0.000000827914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0026  tRNA-Leu  86.36 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344693  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0991  tRNA-Leu  86.36 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t13  tRNA-Leu  96.97 
 
 
80 bp  58  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  96.97 
 
 
83 bp  58  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu03  tRNA-Leu  92.68 
 
 
88 bp  58  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0175696  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  96.97 
 
 
83 bp  58  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1969  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2520  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0033  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000096858  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1748  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487544  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0144  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00805168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1797  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0101943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1815  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1022  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0362135  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0018  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123501  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0331  tRNA-Leu  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000146268  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0047  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0158723 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  90.7 
 
 
82 bp  54  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4256  tRNA-Leu  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561598  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  90.7 
 
 
82 bp  54  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  90.7 
 
 
82 bp  54  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  90.7 
 
 
82 bp  54  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0038  tRNA-Leu  85.07 
 
 
87 bp  54  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>