63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24950  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0046  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0019  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.819942 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  82.93 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  82.93 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0043  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.025828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0022  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0051  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075209  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0051  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361468  hitchhiker  0.00416301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0021  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0535721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0017  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.347732  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00250  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.427381  normal  0.701235 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2501  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0059  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0012  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0022  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210524  normal  0.0833879 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0099  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0051  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0049  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0035  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.331877  hitchhiker  0.00233917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0014  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.582798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0014  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.193422  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0018  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742727  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0055  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97975  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>