128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_R0009 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0057  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000872679  normal  0.444657 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  85.39 
 
 		 89 bp  73.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0029  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000126446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0037  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0017  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0035  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.671862 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0025  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.193422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000413572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24950  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  48.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0108  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000140726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0037  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000147646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0039  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0018  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0115557  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0054  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720864  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>