69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Leu-2 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.193422  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0903  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  99.6  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0016  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 84 bp  89.7  9e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.672114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0004  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00803834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0029  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.988938  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0029  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0025  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.426902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0126  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177569  hitchhiker  0.000589421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0041  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0017  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.347732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  84.38 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0025  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132297  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0035  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.331877  hitchhiker  0.00233917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0021  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144859  normal  0.471234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0021  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0535721 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0051  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075209  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0043  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.025828 
 
 
-
 
NC_003295  RS03938  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0051  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361468  hitchhiker  0.00416301 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0015  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20772  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2501  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0059  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0012  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210524  normal  0.0833879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0038  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0099  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0051  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0014  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.582798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0014  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0049  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0055  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97975  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0065  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0092  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  hitchhiker  0.00311227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0063  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200123  decreased coverage  0.00662363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0015  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4554  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232899  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0063  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24950  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  81.71 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>