46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_R0015 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0014  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  0.6782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0025  tRNA-Leu  87.78 
 
 		 86 bp  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1187  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt22  tRNA-Leu  84.44 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt22  tRNA-Leu  84.44 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.59111  normal  0.0140325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0039  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00489607  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0055  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.796576  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0034  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2213  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.193422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0068  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000622539  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3504  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0043  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.264208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t43  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0642422  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA33  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.962701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>