299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0024 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1365  tRNA-Leu  96.39 
 
 		 84 bp  125  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 87 bp  79.8  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  94 
 
 		 81 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  89.23 
 
 		 81 bp  73.8  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 81 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 81 bp  60  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2213  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0039  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00489607  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0009  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0034  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt22  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt22  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0007  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0042  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.59111  normal  0.0140325 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0041  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0554879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0092  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32054  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0001  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1187  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0081  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0012  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0006  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301986  normal  0.331318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0005  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  0.341408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0108  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000140726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0006  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0901728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309276  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t19  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t20  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178087  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4338  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0042  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.566958 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0000161496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0043  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>