More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_R0037 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000477494  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000421149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000758461  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000052132  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t102  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000565255  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0019  tRNA-Leu  97.7 
 
 		 87 bp  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000288253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0031  tRNA-Leu  97.7 
 
 		 87 bp  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000068537  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0038  tRNA-Leu  97.7 
 
 		 87 bp  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000116483  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0020  tRNA-Leu  97.7 
 
 		 87 bp  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000559714  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t101  tRNA-Leu  98.78 
 
 		 87 bp  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000108227  normal  0.0525224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t093  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0126  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553004  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0126  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000786823  normal  0.701139 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0125  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104989  normal  0.132999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0125  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000725635  normal  0.695646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t092  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0109  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000331868  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0025  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0595639  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0123  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0114  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000507523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0115  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0116  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000605534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0033  tRNA-Leu  92.96 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0122  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000181545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0026  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344693  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt10  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0991  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0063  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4554  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  89.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0140  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180283  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0003  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0012  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.898265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0126  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  83.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177569  hitchhiker  0.000589421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0065  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t58  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.544778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t59  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.523446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA2  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA3  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0038  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0063  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200123  decreased coverage  0.00662363 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0099  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.116508  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  88.57 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0107  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.57373  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R11  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0013  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R10  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.919208  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0003  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0002  tRNA-Leu  92 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  87.14 
 
 		 98 bp  67.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0033  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0120  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00172985  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  88.68 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0130  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584266  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0133  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000286761  normal  0.279281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0150  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0128  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00106969  normal  0.52847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0158  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0155  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0055  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.796576  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0127  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000102689  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  88.68 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0124  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141518  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0030  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.551474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0035  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000172953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0152  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0148  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739603  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0093  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000286418  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0095  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0099  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588757  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0122  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.806101  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0013  tRNA-Leu  87.27 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0004  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 83 bp  54  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0092  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  hitchhiker  0.00311227 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0022  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>