299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_R0026 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRAt10  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344693  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0991  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0033  tRNA-Leu  97.7 
 
 		 87 bp  157  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0038  tRNA-Leu  97.7 
 
 		 87 bp  157  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0003  tRNA-Leu  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0063  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4554  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0063  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200123  decreased coverage  0.00662363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0065  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0072  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0036  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230012  normal  0.790911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna27  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0065  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 85 bp  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0064  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 85 bp  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0018  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000477494  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0019  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000288253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0037  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000758461  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0038  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000116483  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0019  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000052132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0031  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000068537  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0020  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000559714  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t102  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000565255  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0030  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000421149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t101  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000108227  normal  0.0525224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0035  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0610176  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna19  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.320912  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t58  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.544778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t59  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.523446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA2  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA3  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0075  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000964905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0015  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0036  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.977915  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0082  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00186312  normal  0.0281447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0086  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0038  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0044  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0043  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0033  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1814  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0044  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00713145  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1968  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1796  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0107643  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2521  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000206835  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0017  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0042  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00515288  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0043  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00336489  normal  0.0463602 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1024  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00686094  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0028  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0191582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0029  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00220383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0030  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00192839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0043  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0955991  normal  0.0560674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0045  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0043  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.002346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0044  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00489579  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0045  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481349  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0058  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.031722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0041  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0042  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00146649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0043  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00579317  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0045  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0150342  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0041  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  0.0670034 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0142  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162702  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0016  tRNA-Leu  89.19 
 
 		 87 bp  83.8  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0051  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 84 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000888669  normal  0.130057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0052  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 84 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000145228  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0053  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 84 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000187871  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0027  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0023  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00937245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0077  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0025  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0680936  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0013  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0057  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0109  tRNA-Leu  93.88 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000331868  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1797  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0101943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R10  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.919208  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5665  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0005  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000679583  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5666  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0006  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301986  normal  0.331318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0005  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  0.341408 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>