142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE_tRNA-Leu-2 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 83 bp  99.6  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  95 
 
 		 86 bp  87.7  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0036  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t20  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.696228  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0037  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0039  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00270882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0029  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0406184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0025  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  85.9 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0030  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0277712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0032  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 84 bp  60  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 84 bp  60  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  88.52 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  84.42 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  88.52 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0020  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0038  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.03097 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R12  tRNA-Leu  84.81 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0043  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0032  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000109128  hitchhiker  0.00302249 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0004  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 81 bp  50.1  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00103905  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0006  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000531495  normal  0.328026 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0095  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0099  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588757  normal  0.145211 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>