39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_R0037 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0036  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 85 bp  151  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0030  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 82 bp  147  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0277712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0032  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0039  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0025  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 82 bp  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t20  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.696228  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R12  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0052  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  88 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0038  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.03097 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0009  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000622539  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0645  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.481512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0031  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.926824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0008  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587789 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4321  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  83.58 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  83.58 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0027  tRNA-Leu  86 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000000908106  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0105  tRNA-Leu  86 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651737  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0022  tRNA-Leu  86 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60230  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4585  tRNA-Leu  86 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0022  tRNA-Leu  86 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0020  tRNA-Leu  86 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24589  normal  0.0928681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>