81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_R0023 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 83 bp  99.6  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  93.06 
 
 		 86 bp  95.6  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  92.42 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t20  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.696228  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  84.34 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0036  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0030  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0277712  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0037  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0039  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0020  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0011  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00270882  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0032  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0025  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0020  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.435653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0100  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568264  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R12  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11040  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.12642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03980  tRNA-Arg  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.280892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0955  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0134122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000236208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0068  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000622539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>