20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_R0039 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0036  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 85 bp  151  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0030  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 82 bp  147  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0277712  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t20  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.696228  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0037  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0025  tRNA-Leu  93.9 
 
 		 82 bp  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0032  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R12  tRNA-Leu  82.72 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000622539  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0645  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.481512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03400  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06707  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna115  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000448705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>