155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_R0047 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  90.14 
 
 
86 bp  85.7  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  93.1 
 
 
81 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.1 
 
 
84 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  93.1 
 
 
84 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  93.1 
 
 
84 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.1 
 
 
84 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.1 
 
 
81 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  93.1 
 
 
86 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  93.1 
 
 
86 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  93.1 
 
 
86 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  93.1 
 
 
86 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  93.1 
 
 
81 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  93.1 
 
 
81 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  93.1 
 
 
81 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  93.1 
 
 
86 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  93.1 
 
 
86 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  93.1 
 
 
86 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  97.62 
 
 
85 bp  75.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0045  tRNA-Leu  92.31 
 
 
85 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  87.5 
 
 
83 bp  71.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  86.59 
 
 
83 bp  67.9  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.37 
 
 
83 bp  67.9  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  89.66 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  89.66 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  89.66 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  89.66 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  89.66 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  89.66 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  89.66 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  89.66 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  89.66 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  89.66 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  89.66 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  89.66 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  89.66 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  89.66 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  89.66 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  89.66 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  89.66 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  89.66 
 
 
81 bp  67.9  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  67.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t20  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.696228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0057  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311538  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  97.3 
 
 
82 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  97.3 
 
 
82 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  84.52 
 
 
84 bp  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0170  tRNA-Leu  87.5 
 
 
84 bp  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159829  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0023  tRNA-Leu  84.52 
 
 
84 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0359439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4256  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0009  tRNA-Leu  84.52 
 
 
84 bp  63.9  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0047  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0158723 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0331  tRNA-Leu  93.18 
 
 
87 bp  63.9  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000146268  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  93.18 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561598  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  94.87 
 
 
84 bp  61.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  89.09 
 
 
84 bp  61.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  87.93 
 
 
84 bp  60  0.00000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  94.74 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0041  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000041426  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0004  tRNA-Leu  86.89 
 
 
81 bp  58  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00103905  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna008  tRNA-Leu  85.94 
 
 
84 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000945853  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  96.77 
 
 
84 bp  54  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  90.7 
 
 
87 bp  54  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0028  tRNA-Leu  96.67 
 
 
85 bp  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0032  tRNA-Leu  89.13 
 
 
83 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000109128  hitchhiker  0.00302249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0057  tRNA-Leu  96.67 
 
 
85 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  94.12 
 
 
82 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  94.12 
 
 
82 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0029  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000562682  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0006  tRNA-Leu  89.13 
 
 
84 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0901728  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
80 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  91.89 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  83.53 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0055  tRNA-Leu  84.62 
 
 
84 bp  50.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.796576  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  83.53 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 
86 bp  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0005  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.570293  normal  0.011385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  83.53 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0039  tRNA-Leu  83.53 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0062  tRNA-Leu  88.64 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.8923600000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0762  tRNA-Leu  88.64 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000162709  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0723  tRNA-Leu  88.64 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0034  tRNA-Leu  88.64 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000358312  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0784  tRNA-Leu  88.64 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000606436  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0691  tRNA-Leu  88.64 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152915  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0459  tRNA-Leu  88.64 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000131572  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0030  tRNA-Leu  88.64 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0277712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>