19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_t20 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_t20  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.696228  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0039  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0036  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0030  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 82 bp  131  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0277712  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0025  tRNA-Leu  93.9 
 
 		 82 bp  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0037  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0032  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  88 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  86.79 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000622539  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0645  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.481512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0043  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.45142e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>